Hit your Wings conta a história do jovem Kaeda Ayamina , de 15 anos, que sonha em jogar futebol no Instituto Wakasuki, escola de ensino médio na qual seu irmão mais velho, Kaeda Aoi, de 21 anos, estudou a alguns anos atrás. 
Ayamina ingressa nessa escola, assim como seu irmão foi no passado, porém, o garoto vive a sombra da estrela que o irmão se tornou (sendo hoje meia do clube Feyernood, da Holanda), e acaba se criando nele uma expectativa enorme por parte da escola e da equipe, que, desde a saída de Aoi, nunca mais foi a mesma. 
Nesse contexto, o protagonista terá que passar por grandes desafios dentro e fora de campo, conhecendo de perto cada membro do seu time e conquistando seu espaço nas quatro linhas.